MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 1442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011981	GCAT	2	8	176157	176164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_011981	CGAC	2	8	176221	176228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
503	NC_011981	CGG	2	6	176254	176259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011981	TCA	2	6	178035	178040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011981	GA	4	8	179067	179074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011981	GAAGG	2	10	180488	180497	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011981	TCCA	2	8	180517	180524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_011981	CAG	2	6	180530	180535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011981	TGA	2	6	180635	180640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011981	GAA	2	6	180645	180650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011981	ACG	2	6	180706	180711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011981	CACTGG	2	12	180723	180734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011981	TGTT	2	8	180736	180743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011981	TTG	3	9	180748	180756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011981	AAC	2	6	180793	180798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011981	CAG	2	6	180885	180890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011981	TCT	2	6	180894	180899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011981	TGAT	2	8	180926	180933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011981	GAT	2	6	180937	180942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011981	GGC	2	6	180972	180977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011981	GCAT	2	8	180983	180990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_011981	A	7	7	181149	181155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011981	CCT	2	6	182789	182794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_011981	GTTT	2	8	184821	184828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011981	TGA	2	6	186092	186097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011981	TTTC	2	8	187294	187301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_011981	CAGG	2	8	187309	187316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
528	NC_011981	G	6	6	187341	187346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011981	CTG	2	6	187358	187363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011981	GTG	3	9	187410	187418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011981	A	6	6	187528	187533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011981	ATATA	2	10	187536	187545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011981	T	6	6	187615	187620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011981	TGC	2	6	187656	187661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011981	ACGA	2	8	187724	187731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_011981	GCC	2	6	187810	187815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_011981	AGC	2	6	187852	187857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011981	GCG	2	6	187858	187863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011981	T	6	6	187911	187916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011981	TCT	2	6	187947	187952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_011981	GAAAA	2	10	187987	187996	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011981	GCG	2	6	188004	188009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011981	CGG	2	6	191546	191551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011981	ATT	2	6	193192	193197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011981	A	6	6	193245	193250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011981	TTG	2	6	193290	193295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011981	CTT	2	6	193314	193319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011981	GAC	2	6	193329	193334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011981	AC	3	6	193358	193363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_011981	GTG	2	6	194189	194194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011981	GGC	2	6	194196	194201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011981	CCG	2	6	194215	194220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_011981	CCT	2	6	196062	196067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_011981	AAC	2	6	196071	196076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011981	TAT	3	9	198719	198727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011981	GT	3	6	198739	198744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011981	GAT	2	6	198848	198853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011981	TTTG	2	8	198888	198895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011981	T	7	7	199033	199039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011981	CT	3	6	199092	199097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_011981	GCC	2	6	199108	199113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_011981	AGA	2	6	199133	199138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011981	TTG	2	6	199142	199147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011981	CTGG	2	8	199355	199362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_011981	AT	3	6	199412	199417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011981	CCT	2	6	199470	199475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_011981	CAG	2	6	199530	199535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011981	CGCGG	2	10	199560	199569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
569	NC_011981	ACC	2	6	199609	199614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_011981	TGCC	2	8	199698	199705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
571	NC_011981	ATG	2	6	199729	199734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011981	AG	3	6	200093	200098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011981	CCG	2	6	200114	200119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_011981	CTCAA	2	10	200125	200134	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
575	NC_011981	GCT	2	6	200176	200181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011981	GCA	2	6	200191	200196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_011981	GGA	2	6	200214	200219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011981	CCG	2	6	200997	201002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_011981	A	6	6	201015	201020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011981	GAG	2	6	203384	203389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011981	CGGC	2	8	205083	205090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_011981	GAG	2	6	205093	205098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011981	GAA	2	6	205168	205173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011981	TGC	2	6	205186	205191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011981	ATC	2	6	205689	205694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011981	CCGAA	2	10	206263	206272	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
587	NC_011981	GAC	2	6	206321	206326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011981	GTAT	2	8	206374	206381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011981	TCT	2	6	206388	206393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011981	ACTG	2	8	206489	206496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_011981	TCG	2	6	206519	206524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011981	GTC	2	6	206542	206547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_011981	ATGG	2	8	206637	206644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011981	TCG	2	6	206697	206702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011981	TGGT	2	8	206709	206716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011981	TTC	2	6	206722	206727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011981	CGT	2	6	206792	206797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011981	ATC	2	6	206818	206823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011981	GCC	2	6	206875	206880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_011981	CGG	2	6	206890	206895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011981	GC	3	6	206938	206943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_011981	GCC	2	6	207046	207051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_011981	GGC	2	6	207137	207142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011981	ATC	2	6	207163	207168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011981	GGCA	2	8	208225	208232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_011981	CG	3	6	212094	212099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_011981	GGGCC	2	10	212135	212144	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
608	NC_011981	GCC	3	9	212142	212150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_011981	GCG	2	6	213095	213100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011981	TCA	2	6	217590	217595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_011981	ACA	2	6	217629	217634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011981	GTATT	2	10	217666	217675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011981	T	6	6	217690	217695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011981	CAAA	2	8	217696	217703	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_011981	TGAT	2	8	217912	217919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011981	GAT	2	6	222503	222508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011981	TTGT	2	8	223287	223294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011981	CTG	2	6	223297	223302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011981	GTCT	2	8	223326	223333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_011981	CGC	2	6	227110	227115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_011981	GCA	2	6	227156	227161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011981	CTG	2	6	228824	228829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_011981	TA	3	6	228848	228853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011981	TTG	2	6	228874	228879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011981	GCC	2	6	228928	228933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_011981	CGT	2	6	228978	228983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011981	GCT	2	6	230156	230161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011981	ATC	2	6	230201	230206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011981	GAT	2	6	230210	230215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011981	GGA	2	6	230231	230236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011981	CGA	2	6	233301	233306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011981	GC	3	6	233315	233320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_011981	GTT	2	6	233331	233336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011981	AAG	2	6	234005	234010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011981	TC	3	6	234069	234074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_011981	GTCG	2	8	235777	235784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_011981	TC	3	6	236447	236452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_011981	GGA	2	6	236571	236576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011981	CGG	2	6	238694	238699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_011981	CGG	2	6	238762	238767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_011981	TCAA	2	8	238797	238804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
642	NC_011981	GCA	2	6	238904	238909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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683	NC_011981	GGC	2	6	278754	278759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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766	NC_011981	GAG	2	6	332179	332184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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913	NC_011981	TTGGA	2	10	389727	389736	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
914	NC_011981	GCC	2	6	389737	389742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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933	NC_011981	T	7	7	400501	400507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
934	NC_011981	TC	3	6	400515	400520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
935	NC_011981	AAC	2	6	400573	400578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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942	NC_011981	TCC	2	6	408796	408801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
943	NC_011981	CTC	2	6	409893	409898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
944	NC_011981	ATATA	2	10	409970	409979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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946	NC_011981	CCT	2	6	412197	412202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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954	NC_011981	ATT	2	6	412711	412716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
955	NC_011981	AGC	3	9	412741	412749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
956	NC_011981	ATC	2	6	412768	412773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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999	NC_011981	ACG	2	6	426829	426834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1000	NC_011981	CGG	2	6	426870	426875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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